助力病原微生物精准检测，天根生化mNGS微生物解决方案亮相IDD创新论坛
2020年11月19日-20日，IDD 2020感染性疾病诊断技术创新论坛在南京金丝利喜来登酒店圆满召开。来自国内外30多位病原检测一线大咖齐聚南京，通过“COVID-19与测序技术会场”和“感染性疾病中的新技术运用会场”两个专场的近30场报告，与300多位诊断行业的同仁共同探讨了COVID-19检测的中国方案，深度剖析了病原微生物检测技术应用的热点与难点。
天根生化研发负责人刘玉方博士为与会者带来主题演讲
“NGS病原微生物解决方案--从样本制备到文库构建”
刘玉方博士主要从待测样本的核酸提取、背景菌防控、宿主核酸去除，以及mNGS建库方案这四个方面，为参会人员介绍了天根生化mNGS病原微生物解决方案，得到了与会嘉宾的广泛关注。
演讲结束后，不断有与会嘉宾涌到天根生化展台，咨询整体方案和相关技术细节。
刘玉方博士演讲精彩要点回顾
病原检测样本类型十分复杂，涉及血清、血浆、脑脊液、肺泡灌洗液、痰液、胸腹水及组织等多种样本，潜在的病原包括细菌、真菌、DNA病毒和RNA病毒等。如何充分裂解样本并高效提取病原核酸，是首要解决的问题。为此，天根生化推出了包含物理、生物酶、化学三大裂解方式的综合性方案，以解决不同样本的核酸提取问题。
病原mNGS检测的灵敏度极高，为避免背景菌的存在影响病因排查和结果判定，做好病原核酸提取及文库构建试剂的背景菌防控是非常必要的。为了满足病原mNGS的检测需求，天根生化进一步优化了提取和建库产品的质检体系，在原有高洁净标准的生产基础上，同时增加了严格质控，实现背景菌防控的双保险。
为了在有限的测序数据中明确真实病原的类型，针对宿主细胞较多的样本去除宿主核酸以提升病原检出的灵敏度是非常必要的，否则容易造成微量病原核酸难以检出，甚至假阴性的结果。天根rRNA去除方案能够有效提升RNA病原的检出Reads数。
在选择宿主核酸去除方案时，要确保能够在特异去除宿主核酸的同时，使微量病原的检出Reads数达到有效提升，为结果判定提供有效支持。
随着病原mNGS检测的时效性需求不断提升，天根生化针对不同建库策略，进行了多步反应体系和Buffer的优化，实现了多步反应一管进行，减少了文库构建过程中的磁珠纯化步骤，仅需2小时就可完成文库构建，用户可以根据检测的实际需求选择合适的文库构建策略。
模拟样本建库测序的实验结果表明，天根生化的DNA文库构建方案、RNA快速文库构建方案、DNA/RNA快速共建库方案及Tn5 DNA快速文库构建方案的模拟病原检出实际Reads数与理论Reads数相比一致性均较好。
随着mNGS检测技术的不断发展，从核酸提取到文库构建的各个环节，在临床应用中还有很多实际问题需要解决。天根生化将会持续优化上述方案，与从事mNGS医检的合作伙伴携手共进，开发出更符合临床应用的解决方案，助力mNGS精准诊断！
