RNA 免疫共沉淀测序技术是将染色质免疫沉淀技术（RNA Immunoprecipitation, RIP）与新一代测序技术（NGS）相结合，能够高效地在全转录组范围内检测与调控蛋白、转录因子等特定蛋白相互作用的RNA。利用该种技术，通过将测序结果精确定位到基因组上，研究人员可获得全转录组范围内与特异蛋白互作的RNA 序列或种类。