全基因组关联分析（Genome-wide association study，GWAS），是指对遗传多样性丰富的群体进行全基因组大样本重测序，在全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），通过各种统计分析方法，从中筛选出与性状相关的 SNPs。GWAS 可快速准确地实现多个目标性状基因的高效定位，进一步获得与这些性状关联的候选基因或基因组区域，具有材料来源广、遗传变异多、性状定位全的优势。