Small RNA 测序是指已有参考基因组的真核生物，从 small RNA 水平全面地研究物种基因功能、调控机制等，揭示生物体特定的生物学过程。 Small RNA 是一类长度小于 50 个核苷酸的 RNA，通常不编码蛋白质，是生命活动重要的调控因子。通过测序分析可以得到物种全基因组水平的 Small RNA 图谱，挖掘新 Small RNA 分子、预测靶基因、样品间差异表达分析和聚类分析等。Small RNA 不仅在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用，而且可以作为癌症诊断、识别、预后的标志物，也在癌症治疗中发挥作用。