真核有参转录组（mRNA Sequencing， mRNA-seq）是指已有参考基因组的真核生物，通过转录组测序技术，能从mRNA水平全面地研究物种基因功能，揭示特定的生物学过程。真核有参转录组测序在检测基因表达水平变化的同时，还能发现稀有转录本，识别可变剪切位点、基因融合（人和小鼠），提供全面的转录组信息。该技术目前已广泛应用于生命科学、疾病诊断和预防及药物研发等领域。